31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04510 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.89 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  42.38 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  36.73 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  39.31 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  31.42 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.59 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  32.17 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.84 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.99 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.79 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.78 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.29 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  23.36 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.26 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.67 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 		 499 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.37 
 
 		 586 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.43 
 
 		 942 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>