90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4246 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  61.76 
 
 		 222 aa  332  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  59.78 
 
 		 222 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  61.03 
 
 		 224 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 		 223 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 		 223 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  52.21 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  52.21 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  51.1 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 236 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  33.21 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 222 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  30.14 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 		 236 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  29.43 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 229 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  29.54 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  26.07 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  26.07 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  27.24 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  30.94 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  28.04 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  27.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  24.91 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  24.45 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4861  dimethyladenosine transferase  76.19 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.250343 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  26.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  53.45 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  24.72 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  36.49 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  24.82 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  31.08 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  33.78 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  35.14 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  33.78 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  32.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  41.54 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  33.78 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  33.75 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0757  phosphoglycerate mutase 1 family protein  34.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.276642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  24.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  27.63 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  30.56 
 
 		 247 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>