More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0078 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  86.04 
 
 		 311 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  80.77 
 
 		 313 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  80.84 
 
 		 313 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  79.1 
 
 		 311 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  78.9 
 
 		 303 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  72.81 
 
 		 331 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  72.51 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  74.76 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  66.34 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  67.73 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  63.78 
 
 		 303 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  62.82 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  62.06 
 
 		 303 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  62.75 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  62.75 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  62.75 
 
 		 297 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  62.75 
 
 		 297 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  62.34 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  62.09 
 
 		 295 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  62.09 
 
 		 295 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  61.76 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  61.44 
 
 		 295 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  62.75 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  62.75 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  62.09 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  59.02 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  61.86 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  56.29 
 
 		 283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  60.9 
 
 		 300 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  54.1 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  52.2 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  51.16 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  46.35 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  50.16 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  46.95 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  52.81 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  49.52 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  46.79 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  46.93 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  47.6 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  47.74 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  46.95 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  47.96 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  47.12 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  50 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  48.06 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  48.06 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  44.98 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  45.16 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  50.83 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  44.66 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  43.97 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  47.1 
 
 		 290 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  45.63 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  45.48 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  45.48 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  45.48 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  46.84 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  42.99 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  45.48 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  46.52 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  44.16 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  42.99 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  42.99 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  45.6 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  44.05 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  47.74 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  45.31 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  47.77 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  45.87 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  46.65 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  44.73 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  46.65 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  46.45 
 
 		 293 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  47.1 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  47.78 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  45.9 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  44.06 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  46.15 
 
 		 289 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  48.13 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  45.75 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  46.89 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  46.56 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  45.51 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  44.01 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  50.21 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  42.95 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.37 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  46.41 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.13 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  46.42 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>