151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5273 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  61.99 
 
 
797 aa  1031    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  69.02 
 
 
811 aa  1131    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  45.63 
 
 
792 aa  719    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  59.87 
 
 
789 aa  1001    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  69.5 
 
 
802 aa  1177    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  52.76 
 
 
835 aa  875    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  63.06 
 
 
834 aa  1068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  60.46 
 
 
788 aa  985    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  56.4 
 
 
792 aa  958    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  58.32 
 
 
792 aa  957    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  61.42 
 
 
812 aa  1021    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  61.29 
 
 
811 aa  1023    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  56.62 
 
 
795 aa  942    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  63.72 
 
 
793 aa  1078    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  69.5 
 
 
802 aa  1178    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  63.9 
 
 
804 aa  1086    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  62.52 
 
 
809 aa  1048    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  68.81 
 
 
796 aa  1148    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  61.86 
 
 
807 aa  1038    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  68.59 
 
 
1228 aa  1131    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  61.65 
 
 
802 aa  1006    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  60.86 
 
 
784 aa  961    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  62.13 
 
 
784 aa  992    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  56.82 
 
 
791 aa  948    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  56.82 
 
 
791 aa  948    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  94.6 
 
 
797 aa  1582    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  56.45 
 
 
783 aa  960    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  59.47 
 
 
784 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  64.25 
 
 
793 aa  1054    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  62.28 
 
 
802 aa  1041    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  60.25 
 
 
806 aa  1013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  60.57 
 
 
800 aa  999    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  71.12 
 
 
821 aa  1201    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  61.9 
 
 
794 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  54.93 
 
 
820 aa  899    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  56.38 
 
 
823 aa  939    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  61.72 
 
 
792 aa  1020    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  61.57 
 
 
800 aa  1018    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  57.55 
 
 
820 aa  951    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  47.59 
 
 
794 aa  753    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  45.09 
 
 
817 aa  703    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  47.79 
 
 
818 aa  778    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  45.74 
 
 
788 aa  755    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  43.91 
 
 
813 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  56.37 
 
 
811 aa  932    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  56.93 
 
 
810 aa  961    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  59.68 
 
 
797 aa  995    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  63 
 
 
798 aa  1042    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  57.32 
 
 
824 aa  960    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  60.25 
 
 
806 aa  1013    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  58.29 
 
 
832 aa  948    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  68.09 
 
 
1230 aa  1122    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  61.31 
 
 
790 aa  1002    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  68.11 
 
 
815 aa  1144    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  69.38 
 
 
802 aa  1181    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  47.5 
 
 
823 aa  779    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  60.13 
 
 
806 aa  1012    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  59.02 
 
 
837 aa  990    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  58.5 
 
 
823 aa  970    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  59.37 
 
 
800 aa  989    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  52.86 
 
 
787 aa  873    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  67.51 
 
 
813 aa  1131    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  66.37 
 
 
820 aa  1100    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  62.2 
 
 
805 aa  1035    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  59.62 
 
 
792 aa  997    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  55.23 
 
 
791 aa  900    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  49.25 
 
 
803 aa  804    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  59.79 
 
 
790 aa  998    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  61.7 
 
 
797 aa  1019    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  59.21 
 
 
833 aa  964    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  61.81 
 
 
783 aa  1001    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  58.68 
 
 
795 aa  994    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  69.26 
 
 
1305 aa  1136    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  60.12 
 
 
811 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  62.6 
 
 
794 aa  1021    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  59.47 
 
 
832 aa  966    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  61.15 
 
 
802 aa  1001    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  52.21 
 
 
811 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  59.75 
 
 
800 aa  988    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  47.7 
 
 
782 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  61.29 
 
 
811 aa  1023    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  59.88 
 
 
811 aa  1007    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  60.74 
 
 
851 aa  968    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  60.58 
 
 
860 aa  994    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  59.09 
 
 
789 aa  972    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  58.58 
 
 
832 aa  930    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  59.67 
 
 
795 aa  989    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  82.81 
 
 
794 aa  1378    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  100 
 
 
797 aa  1657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  61 
 
 
811 aa  1018    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  60.1 
 
 
791 aa  1021    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  48.01 
 
 
825 aa  771    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  62.61 
 
 
783 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  47.56 
 
 
793 aa  783    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  62 
 
 
798 aa  1052    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  63.06 
 
 
795 aa  1063    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  68.34 
 
 
1230 aa  1125    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  53.18 
 
 
835 aa  880    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  68.11 
 
 
815 aa  1144    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  59.15 
 
 
796 aa  979    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>