More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1930 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  100 
 
 		 330 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  88.41 
 
 		 388 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  90.24 
 
 		 425 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  100 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  98.79 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  93.62 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  87.08 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  68.5 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  68.5 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  68.5 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  67.58 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  67.58 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  68.6 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  61.7 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  57.98 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  60.26 
 
 		 413 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  57.67 
 
 		 408 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  60.61 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  59.7 
 
 		 401 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  52.74 
 
 		 415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.56 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  50.32 
 
 		 430 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.17 
 
 		 443 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.62 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.62 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  44.82 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  54.65 
 
 		 396 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  52.05 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  52.05 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  50.91 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  60.82 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  44.91 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  53.52 
 
 		 401 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  47.48 
 
 		 393 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  53.33 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  46.08 
 
 		 393 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  45.43 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  45.45 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  45.11 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  46.08 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  45.11 
 
 		 393 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  50.79 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  45.74 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  51.72 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  44.31 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  47.2 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.09 
 
 		 405 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  52.62 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  53.46 
 
 		 426 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.91 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.82 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  48.01 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  50.77 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.58 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.9 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.9 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  47.27 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  49.23 
 
 		 404 aa  225  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.7 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  51.9 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.74 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  48.89 
 
 		 405 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  59.4 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  51.54 
 
 		 392 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.97 
 
 		 411 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  54.55 
 
 		 398 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  50.93 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  46.22 
 
 		 412 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  42.38 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  47.84 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  42.63 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  40.78 
 
 		 390 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  38.41 
 
 		 383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  41.16 
 
 		 383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  40.49 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  40.67 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  40.71 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  41.39 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  42.68 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  35.6 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  40.19 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  38.23 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  58.6 
 
 		 158 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  39.55 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  37.39 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  41.08 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  37.39 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.5 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  37.39 
 
 		 382 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  34.23 
 
 		 404 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  37.23 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  40 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  41.62 
 
 		 381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  38.56 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.79 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  39.8 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  32.14 
 
 		 493 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05427  chromate ion transporter (Eurofung)  31.14 
 
 		 523 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00300888  normal  0.119006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2059  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.63 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0581027 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  30.99 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>