79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1492 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  100 
 
 
205 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  98.59 
 
 
142 aa  283  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  79.56 
 
 
143 aa  230  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  72.99 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  73.91 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  73.72 
 
 
152 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  72.46 
 
 
182 aa  204  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  70.29 
 
 
157 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  70.29 
 
 
157 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  70.29 
 
 
157 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  62.04 
 
 
288 aa  183  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  64.23 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  62.59 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  62.04 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  57.66 
 
 
285 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  59.26 
 
 
271 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  57.35 
 
 
287 aa  170  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  58.57 
 
 
144 aa  167  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  59.85 
 
 
276 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  58.52 
 
 
271 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  54.01 
 
 
285 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  61.31 
 
 
276 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  60.16 
 
 
128 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  57.66 
 
 
276 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  59.12 
 
 
276 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  59.85 
 
 
276 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  57.66 
 
 
276 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  59.12 
 
 
276 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  58.82 
 
 
273 aa  159  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  56.93 
 
 
297 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  57.66 
 
 
276 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.26 
 
 
281 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.26 
 
 
281 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  54.81 
 
 
272 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  57.04 
 
 
277 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  54.81 
 
 
272 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  56.34 
 
 
275 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  47.14 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  43.26 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  43.57 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  38.06 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  36.17 
 
 
333 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.71 
 
 
363 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.85 
 
 
328 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  37.78 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  32.06 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  32.58 
 
 
306 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  35.07 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  35.07 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  57.89 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  35.07 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  35.07 
 
 
331 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  35.07 
 
 
303 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  35.07 
 
 
303 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  34.81 
 
 
273 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  35.07 
 
 
312 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  30.53 
 
 
313 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36.3 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  34.33 
 
 
273 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  36.57 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  30 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  29.79 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  35.82 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.34 
 
 
320 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.34 
 
 
320 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  32.84 
 
 
324 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  35.04 
 
 
320 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  35.59 
 
 
324 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
320 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
320 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
320 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.3 
 
 
332 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  31.34 
 
 
320 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  31.69 
 
 
323 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>