32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0074 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0074    100 
 
 
1224 bp  2426    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0448456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  85.24 
 
 
1227 bp  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  85.32 
 
 
1227 bp  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  85.9 
 
 
1392 bp  914    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3211    100 
 
 
903 bp  1748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3210    100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  99.75 
 
 
1245 bp  2403    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  99.35 
 
 
1248 bp  2365    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  100 
 
 
903 bp  1748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  100 
 
 
903 bp  1748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  85.5 
 
 
1227 bp  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  99.59 
 
 
1245 bp  2387    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  86.79 
 
 
1227 bp  1021    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  95.2 
 
 
1233 bp  1869    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  85.41 
 
 
1227 bp  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  85.33 
 
 
1227 bp  870    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3482    81.82 
 
 
1233 bp  60  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.556339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  90.7 
 
 
1269 bp  54  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  88 
 
 
1176 bp  52  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  84.29 
 
 
1233 bp  52  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  91.89 
 
 
1257 bp  50.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  93.94 
 
 
1218 bp  50.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  93.94 
 
 
1218 bp  50.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  86.79 
 
 
1146 bp  50.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1083 bp  50.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  90 
 
 
1131 bp  48.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  91.67 
 
 
1239 bp  48.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  93.75 
 
 
1218 bp  48.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  100 
 
 
1194 bp  48.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  96.43 
 
 
2481 bp  48.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>