18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3210 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0074    100 
 
 
1224 bp  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0448456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3210    100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  99.7 
 
 
1245 bp  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  100 
 
 
330 bp  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  99.39 
 
 
1245 bp  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  98.2 
 
 
1248 bp  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  93.04 
 
 
1233 bp  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  86.32 
 
 
1227 bp  170  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  86.32 
 
 
1227 bp  170  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  85.79 
 
 
1227 bp  163  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  85.79 
 
 
1227 bp  163  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  85.79 
 
 
1227 bp  163  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  85.26 
 
 
1392 bp  155  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  85.26 
 
 
1227 bp  155  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  91.89 
 
 
1257 bp  50.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  88.64 
 
 
1176 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  88.37 
 
 
1194 bp  46.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>