33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3482 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3482    100 
 
 		 1233 bp  2444    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.556339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  96.19 
 
 		 1233 bp  2072    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  79.71 
 
 		 1278 bp  258  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  81.86 
 
 		 1257 bp  258  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  88.55 
 
 		 1239 bp  141  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  82.22 
 
 		 1227 bp  77.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  82.22 
 
 		 1227 bp  77.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  82.22 
 
 		 1227 bp  77.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  82.09 
 
 		 1194 bp  75.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  89.47 
 
 		 1284 bp  65.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  81.6 
 
 		 1392 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  94.87 
 
 		 1149 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  90.2 
 
 		 1227 bp  61.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  81.82 
 
 		 1245 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0074    81.82 
 
 		 1224 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0448456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  81.82 
 
 		 903 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  90 
 
 		 1185 bp  60  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  81.82 
 
 		 903 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  81.82 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  81.82 
 
 		 1245 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3211    81.82 
 
 		 903 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  91.11 
 
 		 1185 bp  58  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  96.97 
 
 		 1269 bp  58  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  90.91 
 
 		 1149 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  89.58 
 
 		 1233 bp  56  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  87.5 
 
 		 1176 bp  56  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  88.24 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  81.08 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  88 
 
 		 1146 bp  52  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  90.24 
 
 		 1131 bp  50.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  88.89 
 
 		 1158 bp  50.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  85.71 
 
 		 1227 bp  48.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  90 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>