29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7190 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  33.1 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  45.56 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  36.11 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  38.81 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  35.77 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  37.4 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  29.27 
 
 		 469 aa  60.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  38.46 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  39.1 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  36.19 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  43.59 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  42.05 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  30.59 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  40.96 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  28.43 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5760  hypothetical protein  49.02 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3480  hypothetical protein  45.76 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3156  hypothetical protein  45.76 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>