More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4988 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  100 
 
 
395 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  29.2 
 
 
407 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  29.2 
 
 
407 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  29.2 
 
 
407 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  30.08 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  28.39 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  31.09 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  24.63 
 
 
690 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  28.36 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  27.49 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  28.79 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  29.58 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  26.36 
 
 
691 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.47 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.23 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  23.73 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  23.73 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  27.79 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.5 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  27.79 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.64 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.61 
 
 
660 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  41.25 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  27 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  26.61 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.63 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  24.7 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  27.43 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  25.94 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  26.69 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.61 
 
 
660 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.51 
 
 
690 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  28.54 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  32.29 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  25.45 
 
 
688 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.11 
 
 
658 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  25.06 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.11 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  27.68 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  27.03 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  29.44 
 
 
607 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  24.82 
 
 
713 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  27.52 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  26.55 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  31.28 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  26.55 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  35.03 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.18 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  25.88 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  23.88 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  24.75 
 
 
660 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  29.19 
 
 
584 aa  60.8  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  23.92 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  23.8 
 
 
690 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  23.37 
 
 
605 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  37.18 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  31.61 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  25.44 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  20 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  27.05 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  23.26 
 
 
425 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  23.98 
 
 
681 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  23.02 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  25 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  28.22 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  28.74 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  23.89 
 
 
675 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  30.63 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  30.95 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  27.44 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  24.8 
 
 
759 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  22.86 
 
 
637 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  26.13 
 
 
338 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  24.35 
 
 
682 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  34.41 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  34.55 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  32.1 
 
 
710 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  33.91 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  32.54 
 
 
671 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  27.3 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  29.61 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3492  acyltransferase 3  25.41 
 
 
531 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  26.84 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  25.25 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  29.41 
 
 
622 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  26.17 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.37 
 
 
777 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.32 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  27.13 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  33.71 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  30.51 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  30.57 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  32.18 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.17 
 
 
656 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  33.75 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  26.09 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  25.52 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  25.28 
 
 
684 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.82 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  26.09 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>