More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0005 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  55.73 
 
 
203 aa  217  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  57.22 
 
 
222 aa  217  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  54.12 
 
 
194 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  54.26 
 
 
199 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  54.26 
 
 
199 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  56.48 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  54.64 
 
 
200 aa  208  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  52.66 
 
 
199 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  54.64 
 
 
200 aa  207  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  52.38 
 
 
199 aa  207  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  52.94 
 
 
194 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  56.12 
 
 
208 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  52.69 
 
 
199 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  59.79 
 
 
207 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  51.53 
 
 
200 aa  198  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  51.6 
 
 
201 aa  198  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  51.85 
 
 
199 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  52.08 
 
 
203 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  54.36 
 
 
204 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  51.08 
 
 
199 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  53.4 
 
 
217 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 
212 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  54.86 
 
 
198 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  53.89 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  50.79 
 
 
200 aa  178  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  46.81 
 
 
211 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  55.81 
 
 
194 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 
197 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  51.83 
 
 
201 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  47.67 
 
 
197 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  50.87 
 
 
204 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  47.15 
 
 
197 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  47.45 
 
 
201 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  47.15 
 
 
202 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  48.44 
 
 
207 aa  155  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  51.74 
 
 
198 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  46.35 
 
 
229 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  46.03 
 
 
215 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  40.78 
 
 
200 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  41.27 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  39.2 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  40.1 
 
 
192 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  35.08 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  41.58 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 
297 aa  111  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 
211 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  36.32 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  36.98 
 
 
207 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  33.14 
 
 
198 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  39.49 
 
 
207 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  38.1 
 
 
200 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  39.55 
 
 
201 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  35.08 
 
 
198 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 
200 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  40.8 
 
 
210 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  37.17 
 
 
201 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
200 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  38.54 
 
 
202 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 
200 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  35.75 
 
 
211 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
200 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
200 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
200 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 
211 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
200 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  29.29 
 
 
200 aa  101  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 
200 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0108  dephospho-CoA kinase  30.53 
 
 
201 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  36.46 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  36.92 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
317 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  37.36 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  36.51 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  35.26 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  35.63 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  35.05 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  37.14 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  36.05 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  32.82 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  31.82 
 
 
214 aa  94.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  31.72 
 
 
541 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  30.46 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  36.57 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  35.06 
 
 
207 aa  94.4  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>