More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0187 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  46.73 
 
 
108 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  45.63 
 
 
109 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.98 
 
 
110 aa  107  7e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  46.94 
 
 
112 aa  106  8e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  41.28 
 
 
109 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  44.86 
 
 
109 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.93 
 
 
120 aa  104  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  43.12 
 
 
109 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  43.52 
 
 
123 aa  104  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.93 
 
 
108 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  47 
 
 
104 aa  103  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  43.93 
 
 
113 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  46.81 
 
 
106 aa  103  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  45.74 
 
 
105 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  50.59 
 
 
107 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  37.61 
 
 
110 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  48.86 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  47.62 
 
 
114 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  39.45 
 
 
109 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  40.19 
 
 
108 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  50.59 
 
 
107 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  41.28 
 
 
111 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  42.99 
 
 
109 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.45924e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  50.59 
 
 
107 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  42.2 
 
 
110 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  43.12 
 
 
109 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.30614e-09  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  44.86 
 
 
113 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  50 
 
 
105 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.69 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  48.51 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  44.68 
 
 
259 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.35 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37.61 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  46.81 
 
 
105 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  42.2 
 
 
109 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  38.53 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  42.2 
 
 
109 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  39.45 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  39.6 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  41.28 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.90247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  41.28 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  42.55 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  35.78 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  42.45 
 
 
223 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  42.55 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  46.51 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  37.61 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  37.61 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.71604e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  38.32 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.36523e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.15955e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  45.79 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  38.32 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  42.99 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  38.53 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.19 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.19 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.57 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.61 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40.59 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  41.51 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.48 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  40.78 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.39 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  95.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  37.38 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  38.53 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  44.44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  42.86 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  37.74 
 
 
109 aa  95.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  43.43 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  43.43 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  39.25 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  40.4 
 
 
259 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  53.25 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>