214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2071 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  100 
 
 
377 aa  750    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  44.8 
 
 
380 aa  301  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  47.76 
 
 
381 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  46.52 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  45.58 
 
 
384 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  44.59 
 
 
380 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  45.36 
 
 
374 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  44.24 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  42.63 
 
 
380 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  42.63 
 
 
380 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  43.97 
 
 
373 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  41.76 
 
 
371 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  41.82 
 
 
383 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  42.74 
 
 
380 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  39.84 
 
 
381 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  46.13 
 
 
397 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  39.46 
 
 
383 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  42.17 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  42.63 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  40.37 
 
 
380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.02 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.02 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  38.98 
 
 
379 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  41.4 
 
 
384 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  42.93 
 
 
379 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  39.68 
 
 
379 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  39.68 
 
 
379 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  39.4 
 
 
382 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  44.74 
 
 
380 aa  249  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  39.68 
 
 
379 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  37.9 
 
 
379 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.48 
 
 
387 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  38.75 
 
 
378 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  37.9 
 
 
379 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  39.68 
 
 
379 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  40.85 
 
 
381 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  39.41 
 
 
388 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  39.63 
 
 
385 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  44.17 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  38.83 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  40.92 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  40.16 
 
 
378 aa  246  6e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  39.95 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  37.37 
 
 
379 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  42.58 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.43 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  39.37 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  39.37 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  39.84 
 
 
381 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  41.06 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.37 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  39.95 
 
 
382 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  39.95 
 
 
382 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  39.11 
 
 
385 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.46 
 
 
392 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  39.79 
 
 
379 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  41.82 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  39.37 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  37.37 
 
 
394 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2611  glycerate kinase  41.49 
 
 
376 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  39.95 
 
 
382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  39.95 
 
 
382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.57 
 
 
380 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  39.3 
 
 
380 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.3 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.3 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  40 
 
 
378 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  37.1 
 
 
388 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.65 
 
 
381 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.52 
 
 
377 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  37.1 
 
 
388 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  37.1 
 
 
388 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  40.85 
 
 
380 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  38.34 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  39.3 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  41.16 
 
 
378 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  39.02 
 
 
380 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  38.46 
 
 
384 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  36.58 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  37.98 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40.65 
 
 
381 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  36.77 
 
 
381 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.1 
 
 
383 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  37.05 
 
 
394 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  41.62 
 
 
381 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  36.51 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  41.62 
 
 
408 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  38.07 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  41.62 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  36.32 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  41.62 
 
 
408 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  41.62 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  41.62 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  41.62 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  38.34 
 
 
381 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  37.33 
 
 
384 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  38.07 
 
 
381 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  39.02 
 
 
381 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  36.29 
 
 
378 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  38.07 
 
 
381 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>