More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1339 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
260 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.78 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
267 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
255 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
269 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
255 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
247 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
262 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
262 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
266 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.72 
 
 
269 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
275 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
263 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
267 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.78 
 
 
276 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
270 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
264 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
270 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
268 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
271 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
270 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.32 
 
 
271 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.31 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
276 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
276 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.31 
 
 
272 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
257 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.92 
 
 
272 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.32 
 
 
270 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.5 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
256 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
270 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.65 
 
 
266 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
276 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.48 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.48 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
270 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.23 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
270 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
270 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
275 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.39 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
269 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.11 
 
 
270 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.22 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
269 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  30.04 
 
 
289 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.67 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.23 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>