More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1156 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  100 
 
 		 120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  69.03 
 
 		 113 aa  153  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  66.37 
 
 		 113 aa  150  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  64.6 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  59.65 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  63.25 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  61.68 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  62.04 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  52.21 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  61.06 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  57.98 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  55.75 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  63.11 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  62.62 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  59.09 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  58.62 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  61.68 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  58.26 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  55.05 
 
 		 212 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  56.14 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  54.13 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  59.41 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  59.41 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  58.49 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  60.38 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  56.86 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  57.41 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  53.1 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  52.68 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  52.14 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  52.21 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  56.73 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 111 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 111 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  54.31 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  62.26 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  54.31 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>