More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0402 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0402  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  7.98388e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  62.35 
 
 
310 aa  324  8e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60 
 
 
270 aa  312  3e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2270  FeS assembly ATPase SufC  59.92 
 
 
264 aa  286  3e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  48.93 
 
 
257 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  48.72 
 
 
257 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.20228e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  47.68 
 
 
263 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  47.68 
 
 
263 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  47.68 
 
 
263 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  44.49 
 
 
250 aa  221  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  47.68 
 
 
253 aa  220  2e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.89 
 
 
253 aa  220  2e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  44.53 
 
 
250 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  47.44 
 
 
257 aa  219  4e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  46.06 
 
 
257 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  43.95 
 
 
252 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  46.64 
 
 
256 aa  218  8e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  42.97 
 
 
252 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  43.9 
 
 
249 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 
250 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  43.85 
 
 
248 aa  216  3e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  45.9 
 
 
267 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  45.06 
 
 
257 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  43.98 
 
 
243 aa  215  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  46.06 
 
 
257 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.29 
 
 
254 aa  214  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  47.41 
 
 
255 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.08508e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  47.44 
 
 
259 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  45.23 
 
 
253 aa  214  1e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  46.91 
 
 
258 aa  214  1e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  42.86 
 
 
250 aa  214  1e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  42.86 
 
 
250 aa  214  1e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  45.42 
 
 
252 aa  214  1e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  42.45 
 
 
250 aa  213  2e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  42.86 
 
 
250 aa  213  2e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  43.67 
 
 
251 aa  213  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  47.83 
 
 
266 aa  213  2e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.37 
 
 
251 aa  213  2e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  42.45 
 
 
250 aa  214  2e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  45.58 
 
 
251 aa  213  3e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  45.23 
 
 
249 aa  213  3e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  45.19 
 
 
256 aa  211  6e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  47.11 
 
 
262 aa  212  6e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.39138e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 
255 aa  212  6e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  44.44 
 
 
246 aa  212  6e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  44.83 
 
 
264 aa  211  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  45.22 
 
 
253 aa  211  8e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  43.72 
 
 
258 aa  211  8e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  43.67 
 
 
248 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  45.8 
 
 
260 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
250 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  40.71 
 
 
252 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  44.21 
 
 
253 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  45.57 
 
 
253 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  42.28 
 
 
252 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 
247 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 
253 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  41.32 
 
 
257 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  41.13 
 
 
250 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  43.09 
 
 
249 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  42.51 
 
 
248 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.11964e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  43.48 
 
 
257 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  42.63 
 
 
261 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  9.97935e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  42.46 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  40.89 
 
 
250 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  45.45 
 
 
252 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  40.56 
 
 
248 aa  208  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  42.17 
 
 
249 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  46.55 
 
 
252 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  43.09 
 
 
247 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  40.4 
 
 
251 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  8.23487e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  44.63 
 
 
247 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  42.86 
 
 
249 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  46.69 
 
 
265 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  45.99 
 
 
252 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  41.43 
 
 
261 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 
264 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  44.98 
 
 
252 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  42.4 
 
 
254 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  41.7 
 
 
261 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  43.6 
 
 
261 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  44.3 
 
 
255 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  41.98 
 
 
260 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  42.62 
 
 
251 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  43.2 
 
 
261 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  43.6 
 
 
261 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 
261 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
261 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
253 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
250 aa  202  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 
261 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
261 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  42.8 
 
 
250 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  40.55 
 
 
261 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  43.21 
 
 
261 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  41.56 
 
 
256 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 
261 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  43.2 
 
 
261 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  42.45 
 
 
253 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  43.2 
 
 
261 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>