More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0096 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.95 
 
 
336 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  45.89 
 
 
315 aa  245  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  44.41 
 
 
321 aa  221  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40.81 
 
 
325 aa  199  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.02 
 
 
311 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.26 
 
 
289 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.45 
 
 
287 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  40.47 
 
 
299 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  42.9 
 
 
334 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  41.19 
 
 
326 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  40.19 
 
 
325 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  37.12 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
328 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.74 
 
 
324 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  40.06 
 
 
333 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.39 
 
 
315 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.97 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.61 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  35.07 
 
 
374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  37.31 
 
 
331 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.64 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  33.89 
 
 
381 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  38 
 
 
297 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  34.59 
 
 
373 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3707  chaperone DnaJ domain protein  40.44 
 
 
337 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.539813 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  34.84 
 
 
313 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  36 
 
 
283 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  34.84 
 
 
341 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  36.57 
 
 
297 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  36.27 
 
 
309 aa  168  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  37.38 
 
 
315 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  33.63 
 
 
335 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  36.25 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  33.33 
 
 
373 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.62 
 
 
326 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  32.6 
 
 
379 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  33.12 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  35.37 
 
 
315 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  31.34 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  37.82 
 
 
294 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.3 
 
 
306 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
380 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  33.12 
 
 
306 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  33.12 
 
 
306 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.3 
 
 
306 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.06 
 
 
335 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  33.12 
 
 
306 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
380 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.56 
 
 
319 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  33.12 
 
 
306 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  33.12 
 
 
306 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.5 
 
 
315 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 
324 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.76 
 
 
324 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  31.61 
 
 
379 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  33.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.8 
 
 
317 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  33.65 
 
 
308 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  33.98 
 
 
306 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.46 
 
 
323 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  34.76 
 
 
330 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  36.79 
 
 
296 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  37.74 
 
 
298 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  33.15 
 
 
366 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  31.84 
 
 
381 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
297 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
380 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  33.71 
 
 
378 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3127  chaperone protein DnaJ  34.08 
 
 
380 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82415  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  33.84 
 
 
335 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.94 
 
 
338 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.01 
 
 
339 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  32.01 
 
 
381 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  32.84 
 
 
368 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  31.9 
 
 
368 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 
379 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.48 
 
 
301 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  34.59 
 
 
361 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.43 
 
 
325 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  36.31 
 
 
323 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.29 
 
 
314 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  35.95 
 
 
304 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  34.37 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  36.54 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2553  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.0279276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.52 
 
 
319 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  36.2 
 
 
341 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  34.39 
 
 
304 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.78 
 
 
302 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.66 
 
 
316 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  31.74 
 
 
374 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>