More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6321 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  69.23 
 
 
506 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.58 
 
 
487 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  99.39 
 
 
491 aa  999    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  70.82 
 
 
495 aa  713    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.02 
 
 
493 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.07 
 
 
491 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.68 
 
 
478 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.41 
 
 
489 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.58 
 
 
498 aa  793    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  77.8 
 
 
489 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.64 
 
 
486 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  72.13 
 
 
498 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.66 
 
 
485 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.7 
 
 
491 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.79 
 
 
478 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  75.42 
 
 
475 aa  764    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.6 
 
 
512 aa  718    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.9 
 
 
485 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.51 
 
 
492 aa  733    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.58 
 
 
494 aa  673    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  77.1 
 
 
488 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.8 
 
 
496 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  75.63 
 
 
478 aa  740    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.09 
 
 
519 aa  719    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.21 
 
 
489 aa  794    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
490 aa  1006    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.6 
 
 
496 aa  752    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  73.47 
 
 
485 aa  760    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.07 
 
 
491 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.13 
 
 
495 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.51 
 
 
492 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.55 
 
 
486 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.42 
 
 
476 aa  745    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  73.53 
 
 
475 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 
476 aa  710    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.21 
 
 
489 aa  794    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.63 
 
 
485 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  72.46 
 
 
483 aa  744    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.58 
 
 
478 aa  761    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  71.76 
 
 
484 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  75.42 
 
 
476 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.03 
 
 
480 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.03 
 
 
480 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
465 aa  604  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.02 
 
 
471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.63 
 
 
466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.49 
 
 
481 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.76 
 
 
472 aa  595  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.18 
 
 
471 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.03 
 
 
471 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.2 
 
 
480 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
473 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.58 
 
 
466 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
471 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
466 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
472 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
466 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
466 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
466 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
479 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.89 
 
 
464 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  61.74 
 
 
512 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
509 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
463 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.22 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.72 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
468 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
476 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.46 
 
 
469 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.34 
 
 
473 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
468 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.36 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.02 
 
 
479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.09 
 
 
468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
468 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.8 
 
 
476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.88 
 
 
481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.13 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.58 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.55 
 
 
462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.17 
 
 
476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.22 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.72 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.68 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.05 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.83 
 
 
473 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.16 
 
 
476 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.3 
 
 
471 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.61 
 
 
477 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.79 
 
 
468 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.37 
 
 
472 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.5 
 
 
479 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.7 
 
 
474 aa  570  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>