179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0082 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  63.93 
 
 
183 aa  246  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  62.5 
 
 
176 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  64 
 
 
181 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21537e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  64.94 
 
 
182 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  60.34 
 
 
192 aa  221  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  66.24 
 
 
181 aa  220  1e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  65.61 
 
 
181 aa  219  2e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  65.61 
 
 
181 aa  219  2e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  62.28 
 
 
184 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  62.07 
 
 
196 aa  217  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  64.97 
 
 
196 aa  207  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  60.9 
 
 
187 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  55.29 
 
 
174 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  57.32 
 
 
177 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  53.76 
 
 
174 aa  179  3e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  48.41 
 
 
165 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
176 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  38.81 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  33.92 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  32.74 
 
 
174 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.15587e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  36.76 
 
 
167 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  35.29 
 
 
172 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  33.79 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  35.25 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  37.5 
 
 
167 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  34.78 
 
 
170 aa  84  1e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  34.78 
 
 
170 aa  83.2  2e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  31.91 
 
 
162 aa  82.8  3e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.20076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  36.76 
 
 
166 aa  82.8  3e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  35.61 
 
 
170 aa  81.3  7e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.39627e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  34.56 
 
 
171 aa  80.9  9e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  32.35 
 
 
170 aa  81.3  9e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  32.81 
 
 
155 aa  79.7  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  32.43 
 
 
175 aa  79.3  3e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  32.82 
 
 
171 aa  79.3  3e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
167 aa  79  4e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  33.53 
 
 
171 aa  79  4e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  29.45 
 
 
163 aa  78.6  5e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  34.35 
 
 
172 aa  78.6  5e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  30.34 
 
 
160 aa  77.4  1e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.33256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 
175 aa  77.4  1e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  34.07 
 
 
175 aa  77.4  1e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  31.68 
 
 
164 aa  76.6  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  28.77 
 
 
163 aa  75.5  4e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  33.78 
 
 
159 aa  75.5  5e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  33.77 
 
 
173 aa  73.9  1e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  33.8 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 
168 aa  73.6  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  34.69 
 
 
168 aa  73.9  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.5071e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  31.82 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
171 aa  73.2  2e-12  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  34.69 
 
 
168 aa  73.6  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  hitchhiker  1.91654e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  32.79 
 
 
166 aa  73.2  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  32.37 
 
 
173 aa  73.6  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  34.69 
 
 
168 aa  73.6  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72.8  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  31.54 
 
 
169 aa  72.4  4e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72  4e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72  4e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.63521e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  28.68 
 
 
163 aa  72  4e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.82999e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72  4e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  72  4e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  31.62 
 
 
165 aa  72  5e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
175 aa  72  5e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  33.82 
 
 
161 aa  71.2  8e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  33.59 
 
 
164 aa  71.2  9e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  29.87 
 
 
162 aa  69.7  2e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  28.83 
 
 
180 aa  70.1  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  33.33 
 
 
164 aa  70.1  2e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
169 aa  69.7  3e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  33.61 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  33.61 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  33.61 
 
 
167 aa  69.3  3e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16343  ferritin  31.62 
 
 
165 aa  69.3  3e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.255913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  28.57 
 
 
172 aa  68.9  4e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  32.52 
 
 
164 aa  68.9  4e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  33.33 
 
 
166 aa  68.6  6e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 
166 aa  68.6  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  34.33 
 
 
166 aa  68.6  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  30.51 
 
 
177 aa  67.8  9e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  32.23 
 
 
176 aa  66.2  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
168 aa  66.6  2e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  33.06 
 
 
181 aa  66.6  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  30.47 
 
 
176 aa  67  2e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  28.92 
 
 
175 aa  66.2  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  35.66 
 
 
172 aa  65.9  3e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
165 aa  65.5  4e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  29.45 
 
 
169 aa  65.5  4e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  30.11 
 
 
177 aa  65.1  5e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  31.01 
 
 
165 aa  65.1  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  28.92 
 
 
175 aa  65.1  6e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  30.46 
 
 
477 aa  64.7  8e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  29.85 
 
 
170 aa  63.9  1e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  30.26 
 
 
175 aa  63.9  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  28.99 
 
 
162 aa  63.2  2e-09  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  29.63 
 
 
168 aa  63.5  2e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  29.32 
 
 
175 aa  63.2  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>