42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0032 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  100 
 
 
265 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  97.36 
 
 
265 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  62.75 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  64.17 
 
 
247 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  54.32 
 
 
262 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  68.54 
 
 
271 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  61.18 
 
 
257 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  58.4 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  37.95 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  34.71 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  31.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  33.64 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  33.07 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  29.3 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  35.25 
 
 
163 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  21.38 
 
 
185 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  23.29 
 
 
174 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  33.98 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  30.14 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.71 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.71 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  24.46 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  57.14 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  30.52 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.32 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  60 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35 
 
 
348 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  60 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.71 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  60 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.01 
 
 
365 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  60 
 
 
321 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  29.13 
 
 
350 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
351 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  58.97 
 
 
321 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  60 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
351 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>