20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0021 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  98.65 
 
 		 249 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  68.97 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  68.03 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  61.9 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  72.11 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  67.59 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  65.03 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  61.94 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  63.19 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  62.69 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  66.25 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  40.13 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  43.7 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  32.59 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  32.59 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  39.23 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  28.16 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  34.21 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>