34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1030 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  43.65 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  43.36 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  43.36 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  43.36 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  41.41 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  42.26 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  43.92 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  43.83 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  38.89 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  40.78 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  40.78 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  40.78 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  40.93 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  40.16 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  38.04 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  40.78 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  39.68 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  38.28 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  38.02 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  37.26 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  34.12 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  37.5 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  39.53 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  38.91 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  38.43 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  33.2 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  33.46 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  31.84 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  31.23 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  31.89 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  30.59 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  39.29 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  31.7 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>