More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0412 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  59.71 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  58.99 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  56.52 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  58.09 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  56.72 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  58.09 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  57.35 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  58.82 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  57.35 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  56.62 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  56.62 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  57.35 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  57.04 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  55.47 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  56.52 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  54.41 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  57.04 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  58.09 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  54.74 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  54.41 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  55.15 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  56.2 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  51.47 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  55.56 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  52.21 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  54.41 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  53.68 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  54.41 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  52.99 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  57.35 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  52.55 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>