115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0068 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0068  protein of unknown function DUF204  100 
 
 
183 aa  338  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.132326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  46.7 
 
 
181 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.92866e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  45.56 
 
 
180 aa  127  8e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.76254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2150  hypothetical protein  49.44 
 
 
180 aa  124  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  44.44 
 
 
195 aa  113  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2394  hypothetical protein  44.62 
 
 
194 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2771  protein of unknown function DUF204  38.42 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  37.22 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5122  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  37.22 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17940  predicted membrane protein  37.02 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  35.14 
 
 
182 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.9704e-06  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.53104e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  36.61 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2394  hypothetical protein  40.11 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0649819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3845  hypothetical protein  35.39 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000297059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3318  protein of unknown function DUF204  35.96 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.861513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.61529e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.32525e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.04735e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.66044e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.11578e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  32.76 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  33.69 
 
 
190 aa  81.6  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  32.26 
 
 
188 aa  82  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  36.16 
 
 
189 aa  81.3  7e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  32.26 
 
 
188 aa  81.3  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  32.26 
 
 
188 aa  81.3  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  32.26 
 
 
188 aa  81.3  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  32.26 
 
 
188 aa  81.3  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  31.49 
 
 
186 aa  77.8  7e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  76.6  2e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  1.9593e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  75.9  3e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3431  protein of unknown function DUF204  35.96 
 
 
183 aa  75.1  6e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  34.81 
 
 
232 aa  74.3  9e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  73.9  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  73.6  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  32.54 
 
 
188 aa  72.8  3e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.08383e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  31.49 
 
 
187 aa  72.4  3e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  32.97 
 
 
188 aa  70.5  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2222  protein of unknown function DUF204  36.94 
 
 
181 aa  69.3  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  28.9 
 
 
191 aa  68.9  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  30.17 
 
 
179 aa  69.3  3e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  31.71 
 
 
200 aa  69.3  3e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  68.2  6e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  30.43 
 
 
190 aa  67.8  9e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  31.58 
 
 
193 aa  67  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  30.11 
 
 
189 aa  66.2  3e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.80885e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  29.51 
 
 
190 aa  65.9  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.04558e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  31.67 
 
 
187 aa  63.9  1e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  29.28 
 
 
188 aa  62.8  2e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  62.8  3e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  62.4  3e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  28.42 
 
 
189 aa  62.4  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  28.43 
 
 
197 aa  62.4  4e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  29.35 
 
 
190 aa  62  5e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  61.6  6e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  61.6  6e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  61.6  6e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.18461e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  29.3 
 
 
190 aa  61.2  7e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  25 
 
 
189 aa  61.2  8e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  26.11 
 
 
181 aa  61.2  9e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  30.34 
 
 
181 aa  60.5  1e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  27.17 
 
 
190 aa  60.8  1e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  60.8  1e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  27.57 
 
 
190 aa  60.1  2e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  27.18 
 
 
195 aa  58.9  3e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.57448e-05  hitchhiker  9.41545e-07 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  28.98 
 
 
194 aa  59.3  3e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  29.26 
 
 
186 aa  58.9  4e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.68239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  30.68 
 
 
196 aa  58.9  4e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  28.09 
 
 
185 aa  58.5  5e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  32.43 
 
 
232 aa  57.8  8e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  25.41 
 
 
198 aa  57.8  8e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.56412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  25.93 
 
 
192 aa  57.8  1e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  25.57 
 
 
181 aa  57  2e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  24.71 
 
 
187 aa  55.8  3e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  23.89 
 
 
187 aa  55.8  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  27.38 
 
 
194 aa  55.8  3e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.7208e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  23.89 
 
 
187 aa  55.8  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  24.71 
 
 
187 aa  55.8  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  28.24 
 
 
192 aa  55.5  4e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  26.37 
 
 
185 aa  55.1  5e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  25.45 
 
 
186 aa  54.7  7e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  28.95 
 
 
182 aa  54.3  9e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0065  protein of unknown function DUF204  37.2 
 
 
181 aa  53.9  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00032233  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  27.43 
 
 
192 aa  53.1  2e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  24.12 
 
 
187 aa  53.1  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  27.75 
 
 
184 aa  53.5  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  30.94 
 
 
188 aa  52.8  3e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  29.79 
 
 
190 aa  52.4  4e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.7692e-05  hitchhiker  2.75934e-05 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  27.91 
 
 
185 aa  52  4e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>