More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1948 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 396 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 396 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 391 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  80.96 
 
 		 396 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  80.96 
 
 		 396 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0845  elongation factor Tu  78.17 
 
 		 396 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000420071  decreased coverage  0.0000129254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 391 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 391 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000026192  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0832  elongation factor Tu  78.17 
 
 		 396 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052918  normal  0.108772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 391 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 391 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 396 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2160  elongation factor Tu  82.53 
 
 		 396 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4392  elongation factor Tu  82.78 
 
 		 396 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 396 aa  702    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  76.14 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  76.14 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  802    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  84.09 
 
 		 396 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  84.34 
 
 		 396 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80.05 
 
 		 396 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80.05 
 
 		 396 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  78.17 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  77.92 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  78.17 
 
 		 396 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 396 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  84.77 
 
 		 396 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 391 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 391 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3356  elongation factor Tu  83.76 
 
 		 396 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 391 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 396 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  83.84 
 
 		 396 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2216  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 396 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3847  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 396 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  83.84 
 
 		 396 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1677  elongation factor Tu  83.76 
 
 		 396 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0620439  hitchhiker  0.0000672774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>