More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3672 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  100 
 
 
311 aa  611  1e-174  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.44 
 
 
306 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  39.07 
 
 
304 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  39.3 
 
 
296 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  39.16 
 
 
296 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  39.16 
 
 
296 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  39.31 
 
 
296 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  38.7 
 
 
296 aa  148  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  36.43 
 
 
316 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  38.87 
 
 
307 aa  141  1e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
310 aa  140  4e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
314 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  35.79 
 
 
319 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  37.63 
 
 
304 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  37.28 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  37.28 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  37.28 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  35.37 
 
 
310 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  33.33 
 
 
519 aa  133  4e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  38.02 
 
 
306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  38.02 
 
 
306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  38.02 
 
 
306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  38.02 
 
 
306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  32.74 
 
 
302 aa  131  2e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  38.03 
 
 
312 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  36.19 
 
 
307 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  37.64 
 
 
306 aa  129  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
295 aa  129  9e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
295 aa  129  9e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  34.62 
 
 
326 aa  127  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  33.21 
 
 
292 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
315 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
321 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  34.83 
 
 
301 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
309 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.1 
 
 
321 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  32.06 
 
 
309 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 
299 aa  119  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  32.52 
 
 
306 aa  118  1e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  34.52 
 
 
494 aa  117  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 
309 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  36.53 
 
 
304 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  34.51 
 
 
311 aa  115  9e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  115  1e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  115  1e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.92606e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.88 
 
 
306 aa  115  1e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  115  1e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 
305 aa  115  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  115  1e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  34.86 
 
 
311 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  30.49 
 
 
321 aa  112  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  34.75 
 
 
392 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  34.75 
 
 
392 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  33.69 
 
 
414 aa  110  4e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  28.92 
 
 
318 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  34.04 
 
 
400 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  34.04 
 
 
400 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
309 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  33.69 
 
 
402 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  30.5 
 
 
292 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  31.62 
 
 
325 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  29.49 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  29.49 
 
 
305 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  29.97 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  29.59 
 
 
305 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  28.23 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.28 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  29.49 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  29.49 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  35.82 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  33.57 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  28.94 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68841e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  26.44 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
348 aa  85.5  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
319 aa  85.1  2e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
313 aa  84  3e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  29.64 
 
 
296 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  29.64 
 
 
296 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  29.64 
 
 
296 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  29.64 
 
 
316 aa  80.1  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  29.25 
 
 
296 aa  79.7  6e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.25 
 
 
395 aa  79.3  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  26.87 
 
 
303 aa  79  9e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  78.6  1e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  29.25 
 
 
296 aa  78.6  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
304 aa  77.4  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.64 
 
 
294 aa  77  4e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.64 
 
 
294 aa  77  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  25.24 
 
 
364 aa  76.6  5e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>