More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0714 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 		 79 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>