37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0496 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  66.06 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  62.04 
 
 
110 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  61.11 
 
 
109 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  61.11 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  58.72 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  58.72 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  58.72 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.41 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.7 
 
 
111 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  52.34 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.88 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.76 
 
 
114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  56.76 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  50.46 
 
 
117 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  52.83 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  54.21 
 
 
110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  52.78 
 
 
111 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  56.1 
 
 
113 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  48.6 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  43.27 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  42.31 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  42.31 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  43.96 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  42.11 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  35.24 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  37.62 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  39.44 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  33.04 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  34.72 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0801583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>