More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0710 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  99.66 
 
 		 301 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  43.57 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 		 309 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.1 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  44.06 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.4 
 
 		 270 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  37.07 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.55 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  44.59 
 
 		 173 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  44.16 
 
 		 158 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  29.55 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.6 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  35.6 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  35.6 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.02 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  36.67 
 
 		 492 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 87 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  47.95 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  39.66 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  51.43 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.75 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  52.17 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 		 86 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  46.58 
 
 		 86 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.72 
 
 		 76 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.72 
 
 		 79 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  46.58 
 
 		 89 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 74 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 		 72 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.72 
 
 		 79 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  50.72 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 86 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  50.72 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 73 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  45.59 
 
 		 81 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 86 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 86 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.99 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  38.24 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 85 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  39.13 
 
 		 75 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  43.66 
 
 		 195 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.56 
 
 		 74 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  46.48 
 
 		 72 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  35.62 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 		 81 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 79 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  37.14 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  36.76 
 
 		 73 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 		 76 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 74 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 		 72 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  32.63 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  43.94 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  43.94 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  43.94 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 		 75 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  43.94 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  30.3 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.24 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>