54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0076 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
499 aa  965  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
499 aa  965  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  44.19 
 
 
488 aa  346  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  42.24 
 
 
478 aa  338  1e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  33.98 
 
 
473 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  34.15 
 
 
488 aa  236  1e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 
488 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 
488 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  34.86 
 
 
488 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  34.7 
 
 
484 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  33.4 
 
 
488 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  34.7 
 
 
484 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  34.7 
 
 
488 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  34.7 
 
 
488 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  34.7 
 
 
484 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  34.7 
 
 
484 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  34.7 
 
 
484 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  34.25 
 
 
488 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  33.81 
 
 
492 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 
488 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  34.01 
 
 
488 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  34.01 
 
 
498 aa  221  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  35.01 
 
 
488 aa  213  8e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  33.33 
 
 
486 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 
429 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  31.64 
 
 
422 aa  166  7e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  32.47 
 
 
424 aa  165  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 
509 aa  164  4e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 
468 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 
419 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
504 aa  78.2  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
507 aa  61.6  3e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
504 aa  58.5  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.53 
 
 
501 aa  55.5  2e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
533 aa  54.7  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 
477 aa  53.5  8e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  1.36517e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 
499 aa  52.8  1e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
492 aa  50.8  5e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.17 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.91 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 
586 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 
468 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.28 
 
 
510 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.28 
 
 
510 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.28 
 
 
510 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.28 
 
 
510 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90639e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.28 
 
 
503 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0073  hypothetical protein  63.64 
 
 
98 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.497418  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.88 
 
 
492 aa  43.5  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>