78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Lys-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0149527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  90 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  90 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0048  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0054  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0014  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0010  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0012  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0011  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0306  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0049  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00205425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>