89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0306 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0306  tRNA-Lys  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2177  tRNA-Lys  85.9 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2220  tRNA-Lys  85.9 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0604  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.398612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  86.15 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  86.15 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  88.46 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  94.29 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  94.29 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  92.31 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  92.31 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  87.04 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  86.21 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0149527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0558  tRNA-Lys  90.48 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  90.48 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.04 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>