78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2868 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2868  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  503  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3859  transposase IS4 family protein  47.01 
 
 
358 aa  230  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1136  transposase, IS4 family protein  44.3 
 
 
352 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4408  transposase, IS4 family protein  44.3 
 
 
352 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0492743  normal  0.342026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3403  transposase, IS4 family protein  41.63 
 
 
352 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.465217 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5446  transposase IS701 family protein  29.13 
 
 
306 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467789 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4468  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6808  transposase IS4 family protein  27.49 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0407  hypothetical protein  26.82 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4630  transposase, IS4 family protein  23.67 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  25 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  25.79 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1692  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3485  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3413  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0628007  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3401  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0858405  normal  0.124182 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3358  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730892  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3354  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3289  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3265  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  25 
 
 
343 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  24.4 
 
 
343 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0872  transposase, IS4 family protein  27.88 
 
 
413 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0884  transposase, IS4 family protein  27.88 
 
 
413 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1795  transposase, IS4 family protein  27.88 
 
 
413 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1207  hypothetical protein  29.25 
 
 
142 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.995879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2754  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2749  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0291  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0862  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3568  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  25 
 
 
389 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2744  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000679967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2289  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000925206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1140  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000344199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3407  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1952  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3704  hypothetical protein  36.92 
 
 
108 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  23.97 
 
 
389 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4657  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3996  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
414 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3088  transposase IS4 family protein  23.85 
 
 
363 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1855  hypothetical protein  29.46 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00672548  normal  0.0405478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  30 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
381 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  30 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0015  transposase, IS4 family protein  26.42 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
381 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  30.93 
 
 
389 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  28.4 
 
 
376 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0073  transposase  38.3 
 
 
130 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0590118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>