61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6808 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6808  transposase IS4 family protein  100 
 
 
332 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  35.82 
 
 
328 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  35.82 
 
 
328 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  35.82 
 
 
328 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  35.82 
 
 
328 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  36.12 
 
 
328 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  35.22 
 
 
328 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3485  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3413  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0628007  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3401  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0858405  normal  0.124182 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3358  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730892  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3354  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3289  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3265  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1692  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
343 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0407  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4468  transposase IS4 family protein  32.3 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1854  hypothetical protein  39.66 
 
 
191 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00930083  normal  0.0408168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2528  hypothetical protein  41.76 
 
 
195 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0686848  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5446  transposase IS701 family protein  29.15 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3859  transposase IS4 family protein  29.18 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4630  transposase, IS4 family protein  32.05 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3403  transposase, IS4 family protein  28.94 
 
 
352 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.465217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1136  transposase, IS4 family protein  27.24 
 
 
352 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4408  transposase, IS4 family protein  27.24 
 
 
352 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0492743  normal  0.342026 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3243  hypothetical protein  30.52 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1207  hypothetical protein  36.62 
 
 
142 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.995879  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3704  hypothetical protein  44.12 
 
 
108 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2868  hypothetical protein  27.49 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1278  hypothetical protein  46.05 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1855  hypothetical protein  34.13 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00672548  normal  0.0405478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2726  hypothetical protein  43.42 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321679  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1208  hypothetical protein  45.16 
 
 
70 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4872  hypothetical protein  40.74 
 
 
57 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3705  hypothetical protein  32.5 
 
 
105 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1263  hypothetical protein  32.5 
 
 
105 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540878  decreased coverage  0.00858549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>