15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3704 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3704  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  227  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0407  hypothetical protein  51.96 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1207  hypothetical protein  75 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.995879  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6808  transposase IS4 family protein  44.12 
 
 
332 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3028  hypothetical protein  65.08 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2726  hypothetical protein  45.83 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321679  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  44.07 
 
 
328 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  44.07 
 
 
328 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  44.07 
 
 
328 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  44.07 
 
 
328 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  44.07 
 
 
328 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  42.37 
 
 
328 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1855  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00672548  normal  0.0405478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2868  hypothetical protein  36.92 
 
 
243 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4468  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 
321 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>