52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3088 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3088  transposase IS4 family protein  100 
 
 
363 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2763  transposase, IS4  95.04 
 
 
363 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.679424  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2793  transposase, IS4  94.49 
 
 
363 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2797  transposase, IS4  94.49 
 
 
363 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2108  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.958109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0925  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.310658  normal  0.553314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0464  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0293358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0308  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2823  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2205  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2659  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2430  transposase, IS4  68.6 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1702  transposase, IS4  68.04 
 
 
363 aa  485  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2805  transposase, IS4  94.09 
 
 
237 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1807  transposase, IS4  68.77 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.911781  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2448  transposase, IS4  94.4 
 
 
232 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506869  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2301  hypothetical protein  66.3 
 
 
281 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2806  hypothetical protein  92.44 
 
 
119 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0211  hypothetical protein  27.17 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0705  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1670  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0317  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  25.91 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  24.68 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3280  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3379  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3566  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2681  transposase IS4 family protein  25 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000123658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5056  hypothetical protein  34.83 
 
 
94 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0568067  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2868  hypothetical protein  23.85 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5446  transposase IS701 family protein  22.97 
 
 
306 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>