28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3740 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  63.95 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  62.59 
 
 		 155 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  53.25 
 
 		 169 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  53.97 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  48.91 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  53.17 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  51.59 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  52.38 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  41.38 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  42.22 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  42.02 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  37.93 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  40.98 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  39.72 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  40.29 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  38.06 
 
 		 332 aa  97.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  36.81 
 
 		 309 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  38.64 
 
 		 305 aa  94  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  36.31 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  39.34 
 
 		 307 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  39.37 
 
 		 309 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  35.21 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  36.64 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  32.06 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.0777007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>