29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2320 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  94.5 
 
 		 309 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  90.82 
 
 		 305 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  91.26 
 
 		 309 aa  547  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  87.21 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  90.15 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  71.05 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  70.03 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  69.44 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  47.4 
 
 		 175 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  45.1 
 
 		 184 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  44.23 
 
 		 183 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  44.23 
 
 		 183 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  52 
 
 		 179 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  51.67 
 
 		 162 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  41.98 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  45.59 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  49.6 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  49.6 
 
 		 176 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  48.31 
 
 		 190 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  41.09 
 
 		 154 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  44 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  38.06 
 
 		 180 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  68.33 
 
 		 64 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  34.25 
 
 		 169 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  41.18 
 
 		 242 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.0777007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>