29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1470 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  386  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  67.13 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  65.73 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  51.09 
 
 		 197 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  53.7 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  51.83 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  57.89 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  47.16 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  54.01 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  57.14 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  55.38 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  47.71 
 
 		 154 aa  157  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  43.59 
 
 		 306 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  47.69 
 
 		 142 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  43.88 
 
 		 143 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.0777007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  43.07 
 
 		 297 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  38.65 
 
 		 332 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  40.56 
 
 		 309 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  48.31 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  48.31 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  48.31 
 
 		 304 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  47.46 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  37.93 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  37.82 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  40.98 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  39.69 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  40.62 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  37.25 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  49.09 
 
 		 64 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>