29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3399 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  92.88 
 
 		 309 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  91.26 
 
 		 332 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  89.32 
 
 		 305 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  89.32 
 
 		 305 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  89.39 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  69.11 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  69.48 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  68.28 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  43.43 
 
 		 175 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  53.85 
 
 		 162 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  45.16 
 
 		 184 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  48.46 
 
 		 183 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  52.03 
 
 		 179 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  48.46 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  44.72 
 
 		 184 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  41.42 
 
 		 197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  46.77 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  40.44 
 
 		 154 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  35.62 
 
 		 169 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  38.52 
 
 		 180 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  70 
 
 		 64 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  42.02 
 
 		 242 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  36.89 
 
 		 143 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.0777007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>