29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0662 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  83.96 
 
 		 184 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  89.7 
 
 		 183 aa  288  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  92 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  71.35 
 
 		 175 aa  261  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  52.53 
 
 		 162 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  55.07 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  56.39 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  49.38 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  55.38 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  52.03 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  51.59 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  52.03 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  45.14 
 
 		 297 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  49.61 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  48.82 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  45.1 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  48.72 
 
 		 305 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  50.43 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  43.48 
 
 		 309 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  44.03 
 
 		 307 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  46.83 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  48.72 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  46.53 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.0777007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  40.71 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>