28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0311 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  321  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  313  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  65.85 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  63.95 
 
 
180 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  50.39 
 
 
183 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  50.39 
 
 
183 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  49.61 
 
 
175 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  48.82 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  49.61 
 
 
184 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  41.27 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  38 
 
 
162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  36.11 
 
 
332 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  38.17 
 
 
305 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  36.69 
 
 
309 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  38.89 
 
 
197 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  37.33 
 
 
179 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  39.53 
 
 
176 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  42.61 
 
 
177 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  39.17 
 
 
309 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  39.23 
 
 
304 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  37.5 
 
 
305 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  35 
 
 
306 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  41.6 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  35.25 
 
 
307 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  35.83 
 
 
297 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  33.12 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  33.82 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.0777007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>