29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2362 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  98.91 
 
 
183 aa  369  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  90.22 
 
 
184 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  86.1 
 
 
184 aa  303  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  76.5 
 
 
175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  52.53 
 
 
162 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  55 
 
 
176 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  57.14 
 
 
190 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  47.31 
 
 
197 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  56.15 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  50.69 
 
 
154 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  53.17 
 
 
180 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  50.36 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  44.58 
 
 
332 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  51.18 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  50.85 
 
 
306 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  50.39 
 
 
155 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  40.96 
 
 
305 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  44 
 
 
297 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  46.15 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  50.43 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  51.28 
 
 
307 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  44.06 
 
 
304 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  46.31 
 
 
169 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  48.72 
 
 
305 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  39.6 
 
 
143 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.0777007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  33.69 
 
 
242 aa  98.2  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>