29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1209 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1209  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2320  hypothetical protein  88.2 
 
 
332 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000123783  hitchhiker  0.0000271901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1434  hypothetical protein  92.13 
 
 
305 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1294  hypothetical protein  88.35 
 
 
309 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3399  hypothetical protein  89.32 
 
 
309 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.806094  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4157  hypothetical protein  92.42 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1650  hypothetical protein  67.21 
 
 
306 aa  417  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.906015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0547  hypothetical protein  67.76 
 
 
307 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0462  hypothetical protein  68.29 
 
 
297 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2831  hypothetical protein  43.86 
 
 
175 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0662  hypothetical protein  43.71 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0978  hypothetical protein  43.29 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4482  hypothetical protein  52.99 
 
 
162 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59400  hypothetical protein  44.74 
 
 
179 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00103738  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2362  hypothetical protein  44.76 
 
 
183 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2226  hypothetical protein  44.76 
 
 
183 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30274  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2925  hypothetical protein  48 
 
 
177 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3296  hypothetical protein  48 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3003  hypothetical protein  42.55 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834657  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1470  hypothetical protein  47.46 
 
 
190 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1738  hypothetical protein  38.97 
 
 
154 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0624  hypothetical protein  41.41 
 
 
142 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0311  hypothetical protein  36.96 
 
 
155 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4106  hypothetical protein  36.23 
 
 
155 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4424  hypothetical protein  38.02 
 
 
143 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.0777007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2689  hypothetical protein  45.26 
 
 
242 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.40181  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1708  hypothetical protein  65 
 
 
64 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3740  hypothetical protein  34.25 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>