34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0617 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  84.21 
 
 		 383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  49.81 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  40.22 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  85.54 
 
 		 136 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  46.03 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  43.2 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  44.25 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  45.13 
 
 		 291 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  45.74 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  41.67 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  33.56 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  41 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  39.62 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  42.55 
 
 		 115 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  38.46 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  38.46 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  35 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  36.19 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  27.13 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  38.04 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  38.04 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1713  hypothetical protein  40.68 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.213277  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  31.39 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  28.93 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  31.39 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  28.36 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  28.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  27.27 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  25 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  27.05 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  24.79 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  30.77 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  30.77 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>