26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1326 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  46.03 
 
 
267 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  44.44 
 
 
383 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  40.14 
 
 
217 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  42.02 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  41.44 
 
 
269 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  36.94 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  39.23 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  38.14 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  37.61 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  32.31 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  47.3 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  36.04 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  34.78 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  34.86 
 
 
115 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  35.51 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  35.51 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  34.91 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  29.66 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  31.9 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  31.9 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  30.77 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  32.77 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  32.77 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  30.25 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  30.25 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>