27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1228 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  73.19 
 
 		 279 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  55.27 
 
 		 273 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  52.17 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  57.44 
 
 		 279 aa  305  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  55.2 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  54.44 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  51.88 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  52.53 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  51.95 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  52.34 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  54.29 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  49.26 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  58.72 
 
 		 150 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  46.56 
 
 		 197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  46.88 
 
 		 132 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  53.33 
 
 		 162 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  59.74 
 
 		 118 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  63.79 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  48 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  44.78 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  39.6 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  55 
 
 		 64 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  27.27 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  29.31 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  51.43 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  31 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>