25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0556 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  64.36 
 
 
279 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  61.19 
 
 
267 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  54.71 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  58.46 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  53.51 
 
 
273 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  54.75 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  53.36 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  53.56 
 
 
279 aa  296  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  50.93 
 
 
279 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  51.88 
 
 
286 aa  284  9e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  51.48 
 
 
279 aa  282  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  51.07 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  59.52 
 
 
132 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  50.43 
 
 
150 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  52.75 
 
 
162 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  39.47 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  49.25 
 
 
77 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  37.33 
 
 
118 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  61.36 
 
 
362 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  54.55 
 
 
64 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  32.1 
 
 
118 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3664  hypothetical protein  68.97 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1602  hypothetical protein  30.23 
 
 
118 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>