22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1262 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  53.33 
 
 		 279 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  60.27 
 
 		 273 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  52 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  53.42 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  50.63 
 
 		 274 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  51.95 
 
 		 279 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  63.79 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  62.07 
 
 		 279 aa  80.5  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  48.68 
 
 		 267 aa  77.4  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  42.65 
 
 		 274 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  43.82 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  40.26 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  40.51 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  44.74 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  40.54 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  57.14 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  41.18 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  47.06 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.143195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>